文献数据库——功能研究 v4.0

第一部分 文献基本信息
title(文献的标题)
pmid(PubMed数据库中文献的编号)
第二部分 文献的研究类型

研究类型分为:现象研究、放射干预研究及功能研究

现象研究:观察不同放射敏感性状细胞系(或动物模型)的特征,并对其遗传分子差异进行比较。例如:基因表达、蛋白表达、甲基化、突变、非编码RNA等。

放射干预研究:对某一细胞系(或动物模型)进行某种辐射干预,观察该细胞系(或动物模型)辐射后遗传分子事件的变化,其目的是研究射线对细胞所造成的遗传学影响。

功能研究:对某一细胞系(或动物模型)进行分子生物学干预,或将其暴露于某种可控的因素下,研究该细胞系(或动物模型)放射敏感性的变化,其目的是研究影响细胞放射敏感性的分子生物学因素和(或)外源物质因素。
该文献是否包含功能研究?(functional study)
该功能研究是否需要填写7份或以上问卷?
(一)起点:对象
1.1 tumor type
1.2 sample type(研究的样本类型)
1.3 intervention object(干预对象-样品名称)
------插入说明------

关于“基因”与“蛋白”的说明:

在 描述基因、基因mRNAs或由其编码的蛋白质水平的变化时,经常会因错误使用命名规则而引发混淆。如果作者一会儿提及基因表达水平,一会儿转至蛋白质水 平,再过一会又回到基因,这只会乱上加乱,尤其是当基因和蛋白质同名时。因此,一般来讲作者会确切地告知读者所提及的到底是基因还是蛋白质。


另一方面,对于基因和蛋白的命名,不同物种有不同的命名 规则,但一般来说,基因名称应写成斜体,蛋白质则采用正体。大小写常用于区分不同物种:一般地,对于小鼠、大鼠和鸡,基因名称首字大写,其余小写;对于 人、灵长类和某些家禽/家畜,基因名称均使用大写字母。

还有,在描述mRNA时一般使用基因名称(如,“levels of p53 mRNA”),也可用“for”来加以连接(如,“levels of the mRNA for p53”)。“表达”(expression)一词通常用于描述基因表达,如果用于描述蛋白质和mRNA水平,就会引发混乱;因此,在提及蛋白质时,建议 不用“express”一词,而是直接改用“level”(或“levels”)。应高度注意所提及物种的适用命名规则;在文章中只要提及蛋白质、基因或mRNA的 名称,应确保其是明白无误的。

•    “Expression of the Igf1 gene was increased in our transgenic mice” (这里在提及基因时使用了斜体并加上“gene”一词,读者能够一目了然)
•    “The levels of IGF1 mRNA were elevated in our patient group” (这是人类基因的正确命名规则)
•    “The serum IGF1 levels were elevated in the transgenic mice” (这里很显然提及的是蛋白质,使用大写字母是适宜的,尽管物种是小鼠,因为这是小鼠蛋白质的正确命名规则)

(二)过程:干预(暴露)
2.1 分子生物学干预
2.1.1 分子生物学干预之一
2.1.1.1 type of molecular biology intervention target(分子生物学干预靶点及其类型)
2.1.1.2 gene name(基因名称)
2.1.1.3 gene id(基因ID)
2.1.1.4 intervention method(干预措施)
2.1.2 分子生物学干预二
2.1.2.1 type of molecular biology intervention target(分子生物学干预靶点及其类型)
2.1.2.2 gene name(基因名称)
2.1.2.3 gene id(基因ID)
2.1.2.4 intervention method(干预措施)
2.2 暴露
2.2.1 暴露一
2.2.1.1 type and name of exposure factors (暴露因素的类型及名称)
2.2.2 暴露二
2.2.2.1 type and name of exposure factors (暴露因素的类型及名称)
2.3 干预(暴露)所引起的中间事件(中间变量)
2.3.1 type of intermediate event(中间事件的类型)
2.3.2 regulatory medium and manner(调控媒介及方式)
2.4 辐射(存在或不存在变量因素)
2.4.1 type of radiation source (干预措施中辐射所采用的射线类型)
2.4.2 radiation dose (干预措施中辐射所采用的照射剂量)
2.4.3 radiation fractionation (干预措施中辐射所采用的分割模式)
(三)终点:结局(放射敏感性变化)
3.1. 结果一
3.1.1. 参照
3.1.2. result of functional study(放疗敏感性的变化)
3.2. 结果二
3.2.1. 参照
3.2.2 result of functional study(放疗敏感性的变化)
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