肺炎克雷伯菌感染病例基因组报告指导临床决策

1. 问卷说明
本问卷全程严格保密，不涉及个人隐私泄露。
问卷答案没有对错之分，请您根据每个病例所提供的信息，基于个人判断作答，谢谢！

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3. 病例1:持续感染 
初始菌株与后续菌株属于同一克隆。
持续性肺炎克雷伯菌肺炎伴菌血症。
感染部位:
菌株A和B：来源于呼吸道。
菌株C: 来源于血液。
感染持续时间: 38 天。
所有菌株均对以下药物耐药: 头孢曲松， 哌拉西林/他唑巴坦，和环丙沙星；
               对以下药物敏感: 美罗培南。

基因组报告结果: 持续感染体内进化分析包括1株初始菌株(菌株A) 和 2株后续菌株(菌株B和C）。
所有菌株均为 ST474。
后续菌株(菌株B和C）相比于初始菌株(菌株A) ：未发现耐药基因获得或突变。
                                                                未发现毒力基因获得。
4. 在本次感染过程中，当后续菌株检出时，您是否会改变当前正在使用的抗菌药物?
5. 在本次感染病程内，当后续菌株检出时，您是否会考虑延长抗菌治疗疗程?
6. 在本次感染病程内，当后续菌株检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议进行感染源控制?（例如:痰液引流、脓肿引流、导管移除、外科或介入评估等）
7. 在本次感染病程内，当后续菌株检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议加强生命体征监测和/或准备升级高级生命支持措施?
9. 病例2:持续感染
基因组相关性:随访菌株与基线菌株属于同一克隆
持续性肺炎克雷伯菌肺炎。
所有菌株均来自同一感染部位 (菌株1 和 2: 呼吸道)。
感染持续时间:13 天。
所有菌株均对以下药物耐药: 美罗培南， 头孢曲松， 哌拉西林/他唑巴坦，和氨曲南。
10. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会改变当前抗菌药物类别?（例如头孢类、碳青霉烯类、喹诺酮类等）
11. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，您会考虑将抗菌治疗疗程延长多久?
12. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议进行感染源控制?（例如:气道分泌物引流、脓肿引流、导管/装置移除、外科或介入评估等）
13. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议加强生命体征监测和/或准备升级高级生命支持措施?
15. 病例3:持续感染
基因组相关性:随访菌株与基线菌株属于同一克隆
持续性肺炎克雷伯菌菌血症。
感染持续时间:7 天。
感染部位:
菌株1 和 2: 血液。
菌株3: 导管。
所有菌株均对以下药物敏感: 美罗培南， 头孢曲松， 哌拉西林/他唑巴坦，和氨曲南。
16. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会改变当前抗菌药物类别?（例如头孢类、碳青霉烯类、喹诺酮类等）
17. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，您会考虑将抗菌治疗疗程延长多久?
18. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议进行感染源控制?（例如:气道分泌物引流、脓肿引流、导管/装置移除、外科或介入评估等）
19. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议加强生命体征监测和/或准备升级高级生命支持措施?
21. 病例4:持续感染
基因组相关性:随访菌株与基线菌株属于同一克隆
持续性肺炎克雷伯菌泌尿生殖系统感染。
菌株来自同一感染部位 (菌株1 和 2: 宫颈)。
感染持续时间:15 天。
所有菌株均对以下药物敏感: 美罗培南， 头孢吡肟， 哌拉西林/他唑巴坦，和氨曲南。
22. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会改变当前抗菌药物类别?（例如头孢类、碳青霉烯类、喹诺酮类等）
23. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，您会考虑将抗菌治疗疗程延长多久?
24. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议进行感染源控制?（例如:气道分泌物引流、脓肿引流、导管/装置移除、外科或介入评估等）
25. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议加强生命体征监测和/或准备升级高级生命支持措施?
27. 病例5:持续感染
基因组相关性:随访菌株与基线菌株属于同一克隆
持续性肺炎克雷伯菌肺炎。
菌株来自同一感染部位 (菌株1 和 2: 呼吸道)。
感染持续时间:18 天。
所有菌株均对以下药物耐药: 美罗培南和头孢曲松。
与基线菌株相比，随访菌株的 头孢他啶/阿维巴坦药敏表型 由敏感转为耐药。
大蜡螟感染模型显示，随访菌株感染后72小时死亡率高于基线菌株。
28. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会改变当前抗菌药物类别?（例如头孢类、碳青霉烯类、喹诺酮类等）
29. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，您会考虑将抗菌治疗疗程延长多久?
30. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议进行感染源控制?（例如:气道分泌物引流、脓肿引流、导管/装置移除、外科或介入评估等）
31. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议加强生命体征监测和/或准备升级高级生命支持措施?
33. 病例6:持续感染
基因组相关性:随访菌株与基线菌株属于同一克隆
持续性肺炎克雷伯菌肺炎。
菌株来自同一感染部位 (菌株1-5: 呼吸道)。
感染持续时间: 35 天。
所有菌株均对以下药物耐药: 头孢曲松和氨曲南;对以下药物敏感: 亚胺培南。
基因组结果:持续感染体内进化分析包括 1株基线菌株， 4株持续感染菌株。
所有菌株均为 ST307。
未发现耐药基因获得。
突变/等位基因变化的耐药基因包括: CTX-M-15 → CTX-M-55 (可能导致广谱头孢菌素耐药水平/谱改变)。
未发现毒力基因获得。
34. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会改变当前抗菌药物类别?（例如头孢类、碳青霉烯类、喹诺酮类等）
35. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，您会考虑将抗菌治疗疗程延长多久?
36. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议进行感染源控制?（例如:气道分泌物引流、脓肿引流、导管/装置移除、外科或介入评估等）
37. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议加强生命体征监测和/或准备升级高级生命支持措施?
39. 病例7:持续感染
基因组相关性:随访菌株与基线菌株属于同一克隆
持续性肺炎克雷伯菌菌血症，伴肺炎和尿路感染。
感染部位:
菌株1: 血液。
菌株2: 导管。
菌株3: 呼吸道。
菌株4: 尿液/尿路。
感染持续时间: 30 天。
所有菌株均对以下药物耐药: 美罗培南， 头孢曲松，和氨曲南。
基因组结果:持续感染体内进化分析包括 1株基线菌株， 3株持续感染菌株。
所有菌株均为 ST11。
未发现耐药基因获得。
主要突变/等位基因变化的耐药基因包括: KPC-2 → KPC-2* (可能导致碳青霉烯类耐药水平/谱改变);sul1^ → sul1 (可能导致磺胺类耐药水平/谱改变);dfrA12 → dfrA12* (可能导致甲氧苄啶耐药水平/谱改变)。
未发现毒力基因获得。
40. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会改变当前抗菌药物类别?（例如头孢类、碳青霉烯类、喹诺酮类等）
41. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，您会考虑将抗菌治疗疗程延长多久?
42. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议进行感染源控制?（例如:气道分泌物引流、脓肿引流、导管/装置移除、外科或介入评估等）
43. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议加强生命体征监测和/或准备升级高级生命支持措施?
45. 病例8:持续感染
基因组相关性:随访菌株与基线菌株属于同一克隆
持续性肺炎克雷伯菌菌血症伴肺炎。
菌株来自同一感染部位 (菌株1-6: 呼吸道)。
感染持续时间: 10 天。
所有菌株均对以下药物敏感: 美罗培南， 头孢曲松，和氨曲南。
46. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会改变当前抗菌药物类别?（例如头孢类、碳青霉烯类、喹诺酮类等）
47. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，您会考虑将抗菌治疗疗程延长多久?
48. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议进行感染源控制?（例如:气道分泌物引流、脓肿引流、导管/装置移除、外科或介入评估等）
49. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议加强生命体征监测和/或准备升级高级生命支持措施?
51. 病例9:持续感染
基因组相关性:随访菌株与基线菌株属于同一克隆
持续性肺炎克雷伯菌菌血症伴肺炎。
感染部位:
菌株1-3 和 8: 呼吸道。
菌株4-7: 血液。
感染持续时间: 48 天。
所有菌株均对以下药物敏感: 美罗培南。
52. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会改变当前抗菌药物类别?（例如头孢类、碳青霉烯类、喹诺酮类等）
53. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，您会考虑将抗菌治疗疗程延长多久?
54. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议进行感染源控制?（例如:气道分泌物引流、脓肿引流、导管/装置移除、外科或介入评估等）
55. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议加强生命体征监测和/或准备升级高级生命支持措施?
57. 病例10:复发/再发感染
基因组相关性:随访菌株与基线菌株属于同一克隆
初次肺炎克雷伯菌肩峰化脓性感染。
再次发生 菌血症 24天后。
感染部位不同。
菌株1: 导管。
菌株2: 血液。
所有菌株均对以下药物敏感: 美罗培南。
复燃感染:体内进化分析包括 1株基线菌株， 1株复燃菌株。
58. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会改变当前抗菌药物类别?（例如头孢类、碳青霉烯类、喹诺酮类等）
59. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，您会考虑将抗菌治疗疗程延长多久?
60. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议进行感染源控制?（例如:气道分泌物引流、脓肿引流、导管/装置移除、外科或介入评估等）
61. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议加强生命体征监测和/或准备升级高级生命支持措施?
63. 病例11:复发/再发感染
基因组相关性:随访菌株与基线菌株属于同一克隆
初次肺炎克雷伯菌肺炎。
再次发生 肺炎 42天后。
感染部位:
菌株1-2: 呼吸道 所有菌株均对以下药物敏感: 美罗培南， 头孢曲松， 哌拉西林/他唑巴坦，和氨曲南。
64. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会改变当前抗菌药物类别?（例如头孢类、碳青霉烯类、喹诺酮类等）
65. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，您会考虑将抗菌治疗疗程延长多久?
66. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议进行感染源控制?（例如:气道分泌物引流、脓肿引流、导管/装置移除、外科或介入评估等）
67. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议加强生命体征监测和/或准备升级高级生命支持措施?
69. 病例12:复发/再发感染
基因组相关性:随访菌株与基线菌株属于同一克隆
初次肺炎克雷伯菌肺炎。
再次发生 尿路感染 50天后。
感染部位不同。
菌株1: 呼吸道。
菌株2: 尿液/尿路。
所有菌株均对以下药物耐药: 美罗培南， 头孢曲松，和氨曲南。
复燃感染:体内进化分析包括 1株基线菌株， 1株复燃菌株。
70. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会改变当前抗菌药物类别?（例如头孢类、碳青霉烯类、喹诺酮类等）
71. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，您会考虑将抗菌治疗疗程延长多久?
72. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议进行感染源控制?（例如:气道分泌物引流、脓肿引流、导管/装置移除、外科或介入评估等）
73. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议加强生命体征监测和/或准备升级高级生命支持措施?
75. 病例13:复发/再发感染
基因组相关性:随访菌株与基线菌株属于同一克隆
初次肺炎克雷伯菌尿路感染。
再次发生 尿路感染 87天后。
感染部位相同。
菌株1-2: 尿液/尿路。
所有菌株均对以下药物耐药: 美罗培南， 头孢曲松， 哌拉西林/他唑巴坦，和环丙沙星。
复燃感染:体内进化分析包括 1株基线菌株， 1株复燃菌株。
76. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会改变当前抗菌药物类别?（例如头孢类、碳青霉烯类、喹诺酮类等）
77. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，您会考虑将抗菌治疗疗程延长多久?
78. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议进行感染源控制?（例如:气道分泌物引流、脓肿引流、导管/装置移除、外科或介入评估等）
79. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议加强生命体征监测和/或准备升级高级生命支持措施?
81. 病例14:复发/再发感染
基因组相关性:随访菌株与基线菌株属于同一克隆
初次肺炎克雷伯菌肺炎。
再次发生 肺炎 19天后。
感染部位:
菌株1-2: 呼吸道。
所有菌株均对以下药物耐药: 美罗培南， 头孢吡肟，和环丙沙星。
复燃感染:体内进化分析包括 1株基线菌株， 1株复燃菌株。
82. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会改变当前抗菌药物类别?（例如头孢类、碳青霉烯类、喹诺酮类等）
83. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，您会考虑将抗菌治疗疗程延长多久?
84. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议进行感染源控制?（例如:气道分泌物引流、脓肿引流、导管/装置移除、外科或介入评估等）
85. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议加强生命体征监测和/或准备升级高级生命支持措施?
87. 病例15:持续感染
基因组相关性:随访菌株与基线菌株属于不同克隆
肺炎克雷伯菌泌尿生殖系统感染。
感染部位相同。
菌株1-2: 宫颈。
感染持续时间: 34 天。
所有菌株均对以下药物敏感: 美罗培南和头孢吡肟。
叠加感染:体内进化分析包括 1株基线菌株， 1 随访菌株。
88. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会改变当前抗菌药物类别?（例如头孢类、碳青霉烯类、喹诺酮类等）
89. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，您会考虑将抗菌治疗疗程延长多久?
90. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议进行感染源控制?（例如:气道分泌物引流、脓肿引流、导管/装置移除、外科或介入评估等）
91. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议加强生命体征监测和/或准备升级高级生命支持措施?
93. 病例16:持续感染
基因组相关性:随访菌株与基线菌株属于不同克隆
肺炎克雷伯菌尿路感染伴肺炎。
感染部位:
菌株1: 尿液/尿路。
菌株2: 呼吸道。
感染持续时间: 5 天。
与基线菌株相比，随访菌株变为 对以下药物敏感: 美罗培南和头孢曲松。
大蜡螟感染模型显示，随访菌株感染后72小时死亡率高于基线菌株。
94. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会改变当前抗菌药物类别?（例如头孢类、碳青霉烯类、喹诺酮类等）
95. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，您会考虑将抗菌治疗疗程延长多久?
96. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议进行感染源控制?（例如:气道分泌物引流、脓肿引流、导管/装置移除、外科或介入评估等）
97. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议加强生命体征监测和/或准备升级高级生命支持措施?
99. 病例17:持续感染
基因组相关性:随访菌株与基线菌株属于不同克隆
肺炎克雷伯菌肺炎。
感染部位:
菌株1-5: 呼吸道。
感染持续时间: 7 天。
所有菌株均对以下药物敏感: 美罗培南和头孢吡肟。
大蜡螟感染模型显示，随访菌株感染后72小时死亡率高于基线菌株。
100. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会改变当前抗菌药物类别?（例如头孢类、碳青霉烯类、喹诺酮类等）
101. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，您会考虑将抗菌治疗疗程延长多久?
102. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议进行感染源控制?（例如:气道分泌物引流、脓肿引流、导管/装置移除、外科或介入评估等）
103. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议加强生命体征监测和/或准备升级高级生命支持措施?
105. 病例18:持续感染
基因组相关性:随访菌株与基线菌株属于不同克隆
肺炎克雷伯菌肺炎。
感染部位:
菌株1-3: 呼吸道。
感染持续时间: 109 天。
所有菌株均对以下药物敏感: 美罗培南和头孢吡肟。
106. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会改变当前抗菌药物类别?（例如头孢类、碳青霉烯类、喹诺酮类等）
107. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，您会考虑将抗菌治疗疗程延长多久?
108. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议进行感染源控制?（例如:气道分泌物引流、脓肿引流、导管/装置移除、外科或介入评估等）
109. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议加强生命体征监测和/或准备升级高级生命支持措施?
111. 病例19:持续感染
基因组相关性:随访菌株与基线菌株属于不同克隆
肺炎克雷伯菌肺炎。
感染部位:
菌株1-6: 呼吸道。
感染持续时间: 14 天。
与基线菌株相比，随访菌株变为 对以下药物耐药: 头孢曲松和哌拉西林/他唑巴坦。
112. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会改变当前抗菌药物类别?（例如头孢类、碳青霉烯类、喹诺酮类等）
113. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，您会考虑将抗菌治疗疗程延长多久?
114. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议进行感染源控制?（例如:气道分泌物引流、脓肿引流、导管/装置移除、外科或介入评估等）
115. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议加强生命体征监测和/或准备升级高级生命支持措施?
117. 病例20:复发/再发感染
基因组相关性:随访菌株与基线菌株属于不同克隆
初次肺炎克雷伯菌肺炎。
再次发生 肺炎 78天后。
感染部位:
菌株1-2: 呼吸道。
所有菌株均对以下药物耐药: 美罗培南和头孢吡肟。
基因组结果:再感染体内进化分析包括 1株基线菌株， 1株再感染菌株。
基线菌株为 ST412，随访菌株为 ST22。
主要获得的耐药基因包括: SHV-1^ (获得青霉素类耐药相关特征);KPC-2 (碳青霉烯类耐药相关特征 获得)。
未发现毒力基因获得。
118. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会改变当前抗菌药物类别?（例如头孢类、碳青霉烯类、喹诺酮类等）
119. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，您会考虑将抗菌治疗疗程延长多久?
120. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议进行感染源控制?（例如:气道分泌物引流、脓肿引流、导管/装置移除、外科或介入评估等）
121. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议加强生命体征监测和/或准备升级高级生命支持措施?
123. 病例21:复发/再发感染
基因组相关性:随访菌株与基线菌株属于不同克隆
初次肺炎克雷伯菌肺炎。
再次发生 肺炎 24天后。
感染部位:
菌株1-2: 呼吸道。
所有菌株均对以下药物敏感: 美罗培南。
基因组结果:再感染体内进化分析包括 1株基线菌株， 1株再感染菌株。
基线菌株为 ST11，随访菌株为 ST1307。
主要获得的耐药基因包括: CTX-M-15 (获得广谱头孢菌素耐药相关特征)。
未发现毒力基因获得。
124. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会改变当前抗菌药物类别?（例如头孢类、碳青霉烯类、喹诺酮类等）
125. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，您会考虑将抗菌治疗疗程延长多久?
126. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议进行感染源控制?（例如:气道分泌物引流、脓肿引流、导管/装置移除、外科或介入评估等）
127. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议加强生命体征监测和/或准备升级高级生命支持措施?
129. 病例22:复发/再发感染
基因组相关性:随访菌株与基线菌株属于不同克隆
初次肺炎克雷伯菌菌血症。
再次发生 尿路感染 70天后。
感染部位:
菌株1: 血液。
菌株2: 呼吸道。
所有菌株均对以下药物耐药: 美罗培南。
基因组结果:再感染体内进化分析包括 1株基线菌株， 1株再感染菌株。
基线菌株为 ST11，随访菌株为 ST65。
主要突变/等位基因变化的耐药基因包括: SHV-31^ → SHV-12 (获得广谱头孢菌素耐药相关特征)。
未发现毒力基因获得。
130. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会改变当前抗菌药物类别?（例如头孢类、碳青霉烯类、喹诺酮类等）
131. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，您会考虑将抗菌治疗疗程延长多久?
132. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议进行感染源控制?（例如:气道分泌物引流、脓肿引流、导管/装置移除、外科或介入评估等）
133. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议加强生命体征监测和/或准备升级高级生命支持措施?
135. 病例23:复发/再发感染
基因组相关性:随访菌株与基线菌株属于不同克隆
初次肺炎克雷伯菌尿路感染。
再次发生 肺炎 40天后。
感染部位:
菌株1: 尿液/尿路。
菌株2: 呼吸道。
所有菌株均对以下药物耐药: 头孢曲松。
基因组结果:再感染体内进化分析包括 1株基线菌株， 1株再感染菌株。
基线菌株为 ST11，随访菌株为 ST1876。
主要获得的耐药基因包括: sul1，sul1，sul2* (获得磺胺类耐药相关特征);tet(A).v2 (四环素类耐药相关特征)。
未发现毒力基因获得。
136. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会改变当前抗菌药物类别?（例如头孢类、碳青霉烯类、喹诺酮类等）
137. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，您会考虑将抗菌治疗疗程延长多久?
138. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议进行感染源控制?（例如:气道分泌物引流、脓肿引流、导管/装置移除、外科或介入评估等）
139. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议加强生命体征监测和/或准备升级高级生命支持措施?
141. 病例24:持续感染
基因组相关性:随访菌株与基线菌株属于同一克隆
持续性肺炎克雷伯菌肺炎。
菌株来自同一感染部位 (菌株1 和 2: 呼吸道)。
两株菌分别为 th25kp031和th25kp323。
随访菌株出现耐药基因改变，涉及 fosA3 → fosA3*。
基因组结果:持续感染体内进化分析包括 1株基线菌株， 1株持续感染菌株。
所有菌株均为 ST11。
未发现毒力基因获得。
142. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会改变当前抗菌药物类别?（例如头孢类、碳青霉烯类、喹诺酮类等）
143. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，您会考虑将抗菌治疗疗程延长多久?
144. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议进行感染源控制?（例如:气道分泌物引流、脓肿引流、导管/装置移除、外科或介入评估等）
145. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议加强生命体征监测和/或准备升级高级生命支持措施?
147. 病例25:持续感染
基因组相关性:随访菌株与基线菌株属于同一克隆
持续性肺炎克雷伯菌肺炎。
菌株来自同一感染部位 (菌株1 和 2: 呼吸道)。
两株菌分别为 TH3067和TH3085。
随访菌株出现耐药基因改变，涉及 SHV-11 → SHV-12。
148. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会改变当前抗菌药物类别?（例如头孢类、碳青霉烯类、喹诺酮类等）
149. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，您会考虑将抗菌治疗疗程延长多久?
150. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议进行感染源控制?（例如:气道分泌物引流、脓肿引流、导管/装置移除、外科或介入评估等）
151. 在该感染窗口内，当后续病原检出时，基于目前提供的信息，您是否会建议加强生命体征监测和/或准备升级高级生命支持措施?
152. 您认为本问卷中病例报告的可读性如何?请填写0-100分，0表示完全不可读，100表示非常清晰易读。
153. 您认为基因组信息对临床决策的潜在帮助有多大?请填写0-100分，0表示完全没有帮助，100表示非常有帮助。
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