2026 年深圳大学高等研究院研究生-生物信息学-第二讲-随堂测验

1. 姓名：_________学号：_________

1、Anvi’o 交互式界面的核心用途是什么？

A、只用于下载测序数据B、交互式查看和探索多维生物信息学数据C、只用于编写 Bash 脚本D、只用于进行序列拼接

2、在 Anvi’o 中，State（状态）主要保存什么内容？

A、原始 FASTQ 文件B、数据库中的全部序列C、界面的配色、层次和组织等显示设置D、服务器的 CPU 使用记录

3、在交互式界面中，Export 功能通常可以导出哪种图形格式？

A、SVGB、MP3C、FASTQD、BAM

4、交互式界面中的 Align 操作主要用于什么？

A、重新进行基因注释B、把 BAM 文件转换成 SAM 文件C、删除所有样本层D、将图形重新对齐到中心位置

5、read recruitment（读段回贴）的基本思想是什么？

A、把短读段比对到参考序列上B、把蛋白质翻译成 DNAC、随机删除低质量 contigD、把多个样本合并成一个 FASTQ

6、在 read recruitment 流程中，BAM 文件主要保存什么？

A、网页界面的颜色设置B、读段比对结果及其坐标信息C、问卷答案D、只保存基因功能名称

7、anvi-profile 的主要作用是什么？

A、把 BAM 中的比对信息整理成 profile 数据库B、把 FASTA 转成图片C、删除所有未比对读段并结束分析D、只生成物种名称列表

8、多个样本分别完成 profiling 后，通常使用哪个程序合并 profile？

A、anvi-run-hmmsB、anvi-mergeC、anvi-export-contigsD、anvi-script-add-default-collection

9、read recruitment 结果中的 coverage 通常反映什么？

A、某个参考序列区域被读段覆盖的程度或平均深度B、样本的测序仪价格C、基因名称的字母长度D、交互界面的窗口大小

10、与平均 coverage 相比，detection 视图特别有助于发现什么？

A、哪些基因在某些样本中未被检测到B、哪些样本使用了哪种操作系统C、哪些图片是 SVG 格式D、哪些 contig 被随机命名

11、Infant Gut Dataset（IGD）教程主要围绕哪类分析展开？

A、基因芯片设计B、基于基因组解析的宏基因组学和手动分箱C、蛋白质晶体学D、医学影像分割

12、宏基因组分箱（binning）时，通常被分配到 bin 中的基本序列单位是什么？

A、contig 或其 splitB、显微镜照片C、样本的采集日期D、问卷选项

13、在 Anvi’o 中，Collection（集合）的主要作用是什么？

A、保存一组 bin 及其包含的 contig/split 归属关系B、存放操作系统补丁C、替代所有 FASTQ 文件D、只记录图片导出时间

14、评价一个 MAG（宏基因组组装基因组）时，通常希望看到怎样的 completeness 和 redundancy？

A、低完整度、高冗余B、高完整度、高冗余C、高完整度、低冗余D、低完整度、低冗余且无序列

15、anvi-refine 的主要用途是什么？

A、在交互界面中进一步检查并精修某个 bin 或 metabinB、下载公共数据库C、把 BAM 转换成 FASTQD、关闭所有样本层

16、口腔微生物组教程中，metabin 策略的一个重要目的是什么？

A、先把多个微生物群体放入较少的大 bin，再进行人工精修B、让每个 bin 只包含一条读段C、完全跳过 read recruitmentD、只输出基因功能注释

17、为什么在 metabin 精修中要结合 differential coverage？

A、不同样本中的覆盖模式可帮助区分不同微生物群体B、它只用于改变图形背景颜色C、它能直接把蛋白质翻译成核酸D、它会自动替代所有人工判断

18、口腔微生物组教程中的 SNV 分析主要关注什么？

A、不同样本间单核苷酸变异模式的比较B、样本的文件压缩率C、交互界面的按钮数量D、contig 的颜色名称

19、在教程示例中，若某个核苷酸位置覆盖度低于 anvi-profile 的默认最低阈值，通常会怎样？

A、一定被判定为高质量 SNVB、不会在该位置识别出 SNVC、自动生成一个新的 contigs databaseD、自动保存为 State

20、完成 bin 精修后，为了把结果写回数据库，通常应执行哪项操作？

A、点击 “Store refined bins in database”B、点击浏览器刷新并删除数据库C、只导出 SVG 而不保存D、重新下载 FASTQ 文件

更多问卷复制此问卷